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Profile

KAWAMURA Akinori

■Faculty: Graduate School of Science and Engineering ■TEL: +81-48-858-3808
■Position: Associate Professor ■FAX:
■Address: 255 Shimo-Okubo, Sakura-ku, Saitama City, Saitama 338-8570, JAPAN ■Mail Address: akawamur＠mail.saitama-u.ac.jp
■Web site: http://devbiol.seitai.saitama-u.ac.jp/
http://www.saitama-u.ac.jp/sci/biological_control/

Profile

Assigned Class

Faculty of Science

Research Field

Developmental Biology
Vertebrate body formation
Vertebrate early evolution
keyword:Vertebrate development , Early vertebrate evolution , Hox genes , body axis , Genetic analysis using mutants , zebrafish , fin formation , Vertebral column , CRISPR-Cas9 , Micro-CT scanning

Academic Background

Graduate School
(Doctor course , 物理学及応用物理学専攻 , 理工学研究科) , 2002(Completed)
(Master course , 物理学及応用物理学専攻 , 理工学研究科) , 1999(Completed)
College
(応用物理学科 , 理工学部) , 1997(Graduated)
Degree
Doctor , Waseda University

Research Career

Research Career
2016 ,
2012 - 2016 ,
2007 - 2012 ,
2005 - 2007 ,
2002 - 2005 ,

Research

Books, Articles, etc.

Books
動物の辞典
朝倉書店:4
末光隆志　総編集

Articles
A globin-family protein, Cytoglobin 1, is involved in the development of neural crest-derived tissues and organs in zebrafish.
,Developmental Biology,472:1-17 2021
Takahashi, K., Ito, Y., Yoshimura, M., Nikaido, M., Yuikawa, T., Kawamura, A., Tsuda, S., Kage, D., Yamasu, K.

An atlas of seven zebrafish hox cluster mutants provides insights into sub/neofunctionalization of vertebrate Hox clusters.
,Development,148:dev198325 2021
Yamada, K., Maeno, A., Araki, S., Kikuchi, M., Suzuki, M., Ishizaka, M., Satoh, K., Akama, K., Kawabe, Y., Suzuki, K., Kobayashi, D., Hamano, N., Kawamura, A.

The role of somite patterning in the formation of Weberian apparatus and pleural rib in zebrafish.
,Journal of Anatomy,236(4):622-629 2020
Akama, K., Ebata, K., Maeno, A., Taminato, T., Otosaka, S., Gengyo-Ando, K., Nakai, J., Yamasu, K., Kawamura, A.

Transcriptional autoregulation of zebrafish tbx6 is required for somite segmentation.
,Development,146(18):dev177063 2019
Ban, H., Yokota, D., Otosaka, S., Kikuchi, M., Kinoshita, H., Fujino, Y., Yabe, T., Ovara, H., Izuka, A., Akama, K., Yamasu, K., Takada, S., Kawamura, A.

Functional roles of the Ripply-mediated suppression of segmentation gene expression at the anterior presomitic mesoderm in zebrafish.
,Mechanisms of Development,152:21-31 2018
Kinoshita, H., Ohgane, N., Fujino, Y., Yabe, T., Ovara, H., Yokota, D., Izuka, A., Kage, D., Yamasu, K., Takada, S., Kawamura, A.

Deadenylation by CCR4-NOT complex contributes to the turnover of hairy-related mRNAs in the zebrafish segmentation clock.
,FEBS Letters,592:3388-3398 2018
Fujino, Y., Yamada, K., Sugaya, C., Ooka, Y., Ovara, H., Ban, H., Akama, K., Otosaka, S., Kinoshita, H., Yamasu, K., Mishima, Y., Kawamura, A.

Enhancer activity-based identification of functional enhancers using zebrafish embryos.
,Genomics ,108:102-107 2016
Taminato, T., Yokota, D., Araki, S., Ovara, H., Yamasu, K., Kawamura, A.

Posterior-anterior gradient of zebrafish hes6 expression in the presomitic mesoderm is established by the combinatorial functions of the downstream enhancer and 3'UTR.
,Developmental Biology,409(2):543-554 2016
Kawamura A, Ovara H, Ooka Y, Kinoshita H, Hoshikawa M, Nakajo K, Yokota D, Fujino Y, Higashijima S, Takada S, Yamasu K

Gbx2 functions as a transcriptional repressor to regulate the specification and morphogenesis of the mid-hindbrain junction in a dose- and stage-dependent manner.
,Mechanisms of Development ,130:532-552 2013
Nakayama, Y., Kikuta, H., Kanai, M., Yoshikawa, K., Kawamura, A., Kobayashi, K., Wang, Z., Khan, A., Kawakami, K., Yamasu, K.

Pou2, a class V POU-type transcription factor in zebrafish, regulates dorsoventral patterning and convergent extension movement at different blastula stages.
,Mechanisms of Development,129:219-235 2012
Khan, A., Nakamoto, A., Okamoto, S., Tai, M., Nakayama, Y., Kobayashi, K., Kawamura, A., Takeda, H., Yamasu, K.

Mesendoderm specification depends on the function of Pou2, the class V POU-type transcription factor, during zebrafish embryogenesis.
,Development, Growth and Differentiation,54:686-701 2012
Khan, A., Nakamoto, A., Tai, M., Saito S., Nakayama, Y., Kawamura, A., Takeda, H., Yamasu, K.

Mesendoderm specification depends on the function of Pou2, the class V POU-type transcription factor, during zebrafish embryogenesis.
,Development, Growth and Differentiation,54:686-701 2012
Khan, A., Nakamoto, A., Tai, M., Saito S., Nakayama, Y., Kawamura, A., Takeda, H., Yamasu, K.

Ripply3, a Tbx1 repressor, is required for development of pharyngeal apparatus and its derivatives in mice
,Development,138:339-348 2011
Okubo T, Kawamura A, Takahashi J, Yagi H, Morishima M, Matsuoka R, and Takada S

FGF receptor gene expression and its regulation by FGF signaling during early zebrafish development
,Genesis,48:707-716 2010
Ota S, Tonou-Fujimori N, Nakayama Y, Ito Y, Kawamura A, and Yamasu K

Activator-to-repressor conversion of T-box transcription factors by the ripply family of Groucho/TLE-associated mediators
,MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY,28(10):3236-3244 200805
Akinori Kawamura;Sumito Koshida;Shinji Takada
電子ジャーナル Web Of Science リポジトリ

Paf1 complex homologues are required for Notch-regulated transcription during somite segmentation
,EMBO Reports,8:858-863 2007
Akanuma T, Koshida S, Kawamura A, Kishimoto Y, Takada S.

Cellular response of the ciliate, Tetrahymena thermophila, to far infrared irradiation
,Photochem Photobiol Sci.,7:99-807 2006
Shiurba R, Hirabayashi T, Masuda M, Kawamura A, Komoike Y, Klitz W, Kinowaki K, Funatsu T, Kondo S, Kiyokawa S, Sugai T, Kawamura K, Namiki H, Higashinakagawa T.

Groucho結合因子Ripply1による分節プログラムの制御
,細胞工学,25:272-273 2006
川村哲規、越田澄人、高田慎治

Groucho-associated transcriptional repressor ripply1 is required for proper transition from the presomitic mesoderm to somites.
,Developmental Cell,9:735-744 200512
Kawamura, A., Koshida, S., Hijikata, H., Ohbayashi, A., Kondoh, H., Takada, S.

Zebrafish hairy/enhancer of split protein links FGF signaling to cyclic gene expression in the periodic segmentation of somites.
,Genes and Development ,19:1156-1161 200506
Kawamura, A., Koshida, S., Hijikata, H., Sakaguchi, T., Kondoh, H., Takada, S.

Zebrafish Polycomb group gene ph2a is required for epiboly and tailbud formation acting downstream of FGF signaling
,Biochem Biophys Res Commun.,328:858-866 2005
Komoike Y, Kawamura A, Shindo N, Sato C, Satoh J, Shiurba R, Higashinakagawa T.

Groucho-associated transcriptional repressor ripply1 is required for proper transition from the presomitic mesoderm to somites
,Developmental Cell,9:735-744 2005
Kawamura A, Koshida S, Hijikata H, Ohbayashi A, Kondoh H, Takada S.

Zebrafish hairy/enhancer of split protein links FGF signaling to cyclic gene expression in the periodic segmentation of somites
,Genes and Development,19:1156-1161 2005
Kawamura A, Koshida S, Hijikata H, Sakaguchi T, Kondoh H, Takada S.

Alternative transcripts of a polyhomeotic gene homolog are expressed in distinct regions of somites during segmentation of zebrafish embryos
,Biochem Biophys Res Commun.,291:245-254 2002
Kawamura A, Yamada K, Fujimori K, Higashinakagawa T.

pc1 and psc1, zebrafish homologs of Drosophila Polycomb and Posterior sex combs, encode nuclear proteins capable of complex interactions
,Biochem Biophys Res Commun.,294:456-463 2002
Kawamura A, Yokota S, Yamada K, Inoue H, Inohaya K, Yamazaki K, Yasumasu I,

Presentation
ゼブラフィッシュ浮き袋の位置と大きさを制限する周辺骨格の役割
第44回 日本分子生物学会 202212
佐藤こうみ、前野哲輝、鈴木賢弥、山田一哉、石坂瑞樹、荒木 颯、安達うらら、古舘宏之、川村哲規

ゼブラフィッシュhoxaa;hoxab;hodaクラスターの発生遺伝学的解析
第44回 日本分子生物学会 202212
石坂瑞樹、山田一哉、前野哲輝、菊地守道、荒木 颯、川村哲規

ゼブラフィッシュ最前方椎骨を規定するHoxコードの解読
第44回 日本分子生物学会 202212
鈴木賢弥、前野哲輝、佐藤こうみ、小林大貴、山田一哉、菅原拓海、石津充己、川村哲規

The position and size of the swim bladder are restricted by the surrounding bones in zebrafish
第27回 小型魚類研究会 202209
Koumi Satoh, Akiteru Maeno, Kenya Suzuki, Kazuya Yamada, Mizuki Ishizaka, Soh Araki1, Urara Adachi, Hiroyuki Furudate, Akinori Kawamura

Developmental genetic analysis of hoxaa;hoxab;hoxda clusters in zebrafish
第27回 小型魚類研究会 202209
Mizuki Ishizaka, Kazuya Yamada, Akiteru Maeno, Morimichi Kikuchi, Soh Araki, Akinori Kawamura

Deciphering the Hox code in the anteriormost vertebrae in zebrafish
第27回 小型魚類研究会 202209
Kenya Suzuki, Akiteru Maeno, Koumi Satoh, Daiki Kobayashi, Kazuya Yamada, Takumi Sugawara, Atsuki Ishizu, Akinori Kawamura

ゼブラフィッシュ器官形成におけるhoxcaおよびhoxcbクラスターの機能解析
第73回 日本動物学会関東支部会 202103
佐藤 こうみ, 鈴木賢弥, 前野 哲輝, 山田 一哉, 荒木 颯, 川村 哲規

ゼブラフィッシュhoxaa,ab,daクラスター三重欠失変異体の解析
ゼブラフィッシュhoxaa,ab,daクラスター三重欠失変異体の解析 202103
石坂瑞樹, 山田一哉, 菊地守道, 前野哲輝, 荒木 颯, 川村哲規

ゼブラフィッシュhoxbaおよびhoxbbクラスター欠失変異体の表現型解析
第43回　日本分子生物学会年会 202012
菊地守道、山田一哉、前野哲輝、荒木 颯、鈴木聖人、石坂瑞樹、赤間 燿、河部由貴、小林大貴、川村哲規

An atlas of zebrafish seven hox cluster mutants provides insights into the functional evolution of the vertebrate Hox clusters
第26回 小型魚類研究会 202011
Kazuya Yamada, Akiteru Maeno, Soh Araki, Morimichi Kikuchi, Masato Suzuki, Mizuki Ishizaka, Koumi Satoh, Kagari Akama, Yuki Kawabe, Kenya Suzuki, Daiki Kobayashi, and Akinori Kawamura

ゼブラフィッシュ遺伝学によるhoxクラスターの機能解析
日本動物学会 第91回大会 202009
川村哲規

ゼブラフィッシュ胚発生におけるhoxクラスターの機能解析
第72回 日本動物学会関東支部会 202003
菊地守道、山田一哉、前野哲輝、荒木 颯、鈴木聖人、石坂瑞樹、赤間 燿、川村哲規

ゼブラフィッシュ成魚の全身骨格および軟組織形成におけるhoxクラスターの機能解析
第72回 日本動物学会関東支部会 202003
鈴木聖人、山田一哉、前野哲輝、菊地守道、荒木 颯、石坂瑞樹、赤間 燿、川村 哲規

成長に伴うゼブラフィッシュの体節間血管の再配置に関する研究
第72回 日本動物学会関東支部会 202003
松野由美香、乙坂栞里、鈴木聖人、川村哲規

Transcriptional autoregulation oftbx6 is required for the somite segmentation in zebrafish embryos
第25回 小型魚類研究会 201909
Ban H, Yokota D, Otosaka S, Kikuchi M, Kinoshita H, Fujino Y, Yabe T, Ovara H, Izuka A, Akama K, Yamasu K, Takada S, Kawamura A.

ゼブラフィッシュ体幹部形成におけるhoxクラスターの機能解析
第71回日本動物学会関東支部会 201903
山田一哉、荒木颯、前野哲輝、菊地守道、赤間燿、弥益恭、川村哲規

ゼブラフィッシュ未分節中胚葉におけるtbx6遺伝子の転写制御機構の解析
第70回　日本動物学会 関東支部大会 201803
伴 博之, 横田 大佑, 乙坂 栞里, 木下 宏史, 藤野 友梨, 矢部 泰二郎, 小原 弘幹, 猪塚 彩花, 赤間 燿, 鹿毛 大地, 弥益 恭, 高田 慎治, 川村 哲規

CRISPR-Cas9を用いたゼブラフィッシュhoxクラスター大規模欠損変異体の作製と解析
第7回 宇都宮大学オプトバイオシンポジウム 201712
荒木 颯、山田一哉、赤間 燿、江幡奏美、弥益 恭、川村哲規

予定体節境界を決定するtbx6遺伝子の発現はpositive autoregulatory loopによって制御される
第7回 宇都宮大学オプトバイオシンポジウム 201712
伴 博之、横田大佑、乙坂栞里、木下宏史、藤野友梨、矢部泰二郎、小原弘幹、猪塚彩花、赤間 耀、鹿毛大地、弥益 恭、高田慎治、川村哲規

Ripply3-mediated restricted modulation of Tbx1 activity in the development of pharyngeal arches
第32回 日本分子生物学会 200912
Okubo T, Yagi H, Kawamura et al.

ゼブラフィッシュ最前部椎骨を規定するHoxコードの発生遺伝学的解析
第74回 日本動物学会関東支部会
鈴木賢弥、前野哲輝、佐藤こうみ、小林大貴、山田一哉、菅原拓海、石津充己、川村哲規